1. Функции по осуществлению государственного контроля и надзора за деятельностью юридических лиц, индивидуальных предпринимателей и граждан по выполнению требований санитарно-эпидемиологического законодательства, законодательства Российской Федерации в области защиты прав потребителей, правил продажи отдельных видов товаров;

2. Возбуждение и рассмотрение дел об административных правонарушениях;

3. Проведение расследований причин возникновения инфекционных и массовых неинфекционных заболеваний людей, причинение вреда окружающей среде;

4. Лицензирование деятельности, связанной с использованием возбудителей инфекционных заболеваний, деятельности в области использования источников ионизирующего излучения;

4.1. Предоставление лицензии на деятельность в области использования источников ионизирующего излучения (генерирующих);

4.2. Переоформление документа, подтверждающего наличие лицензии на деятельность в области использования источников ионизирующего излучения (генерирующих);

4.3. Выдача заверенных копий документов, подтверждающих наличие лицензии на деятельность в области использования источников ионизирующего излучения (генерирующих);

4.4. Выдача дубликата документов, подтверждающих наличие лицензии на деятельность в области использования источников ионизирующего излучения (генерирующих);

4.5. Выдача лицензии на деятельность, связанную с использованием возбудителей инфекционных заболеваний;

4.6. Переоформление документа, подтверждающего наличие лицензии на деятельность, связанную с использованием возбудителей инфекционных заболеваний;

4.7. Выдача дубликата документов, подтверждающих наличие лицензии на деятельность, связанную с использованием возбудителей инфекционных заболеваний.

5. Регистрация впервые внедряемых в производство и ранее не  использовавшихся химических, биологических веществ и изготавливаемых  на их основе препаратов, потенциально опасных для человека (кроме лекарственных средств); по отдельным видам продукции, представляющим потенциальную опасность для человека (кроме лекарственных средств); на отдельные виды продукции, в том числе пищевые продукты, впервые ввозимые на территорию Российской Федерации;

5.1. Государственная регистрация впервые внедряемой продукции, впервые ввозимой на территорию Российской Федерации;

5.2. Внесение изменений в действующее свидетельство о государственной регистрации.

6. Регистрация лиц, пострадавших от радиационного воздействия и подвергшихся радиационному облучению в результате чернобыльской и других радиационных катастроф и инцидентов. 

7. Выдача санитарно-эпидемиологических заключений, включающая выдачу санитарно-эпидемиологических заключений на проектную документацию; на вид деятельности, а так же переоформление санитарно-эпидемиологических заключений.

7.1. Выдача санитарно-эпидемиологического заключения на проектную документацию;

7.2. Получение санитарно-эпидемиологического заключения на вид деятельности;

7.3. Переоформление санитарно-эпидемиологического заключения.

8. Регистрация и учёт уведомлений о начале осуществления юридическими лицами и индивидуальными предпринимателями отдельных видов работ и услуг по перечню, утверждённому Правительством Российской Федерации, за исключением уведомлений, представляемых юридическими лицами и индивидуальными предпринимателями, осуществляющими деятельность на территориях, подлежащих обслуживанию Федеральным медико-биологическим агентством;

9. Функции, предусматривающие размещение заказов на поставку товаров, выполнение работ и оказание услуг для государственных нужд;

10. Обслуживание денежных и (или ) товарных ценностей, хранение и распределение материально-технических ресурсов